水体中的致病性微生物一般并不是水中原有微生物，大部分是从外界环境污染而来，特别是人和其它温血动物的粪便污染。水中常见的致病性细菌主要包括：志贺氏菌、沙门氏菌、大肠杆菌、小肠结炎耶尔森氏菌、霍乱弧菌、副溶血性弧菌等。

在实际控制中，对水质卫生质量的评价和控制，是无法对各种可能存在的致病微生物一一进行检测，而一般利用对指示菌的检测和控制，来了解水体是否受到过人畜粪便的污染，是否有肠道病原微生物存在的可能，从而评价水的质量，以保证水质的卫生安全。

目前，世界各国一般认为大肠菌群是指示水质受粪便污染较好的指示菌。

在某些情况下，水体中的细菌总数也可指示水体受粪便等污染物污染的情况。这里的细菌总数其实是指营养琼脂培养后形成的菌落总数。目前世界各国对于控制饮用水的卫生质量，除采用大肠菌群等指标外，一般还采用细菌总数这个指标。

2018年8月深圳市食药监局组织对全市生产环节经营主体开展抽样检验，行动共抽检生产环节食品272批次，涉及生产环节经营主体167家次，共检测食品指标3361项次。其中检出不合格样品3批次，涉及不合格食品类别为饮料3批次，涉及不合格项目为微生物污染。行动共抽检了饼干、茶叶及相关制品、方便食品等市民日常购买的食品种类，3批次饮用水被检出铜绿假单胞菌超标，涉及深圳市宝源达饮品有限公司生产的活力包装饮用水和康庭包装饮用水、深圳市美地泉饮品有限公司生产的大山岭饮用纯净水。

市食药监局方面透露，抵抗力较差的人群若饮用铜绿假单胞菌不合格的瓶(桶)装水会对人体健康产生危害，容易引起急性肠道炎、脑膜炎、败血症和皮肤炎症等疾病。

市食药监局提醒消费者，购买包装食品应通过正规可靠渠道并保存凭证，看清外包装标签标识中的相关信息，如生产日期、保质期、生产者名称和地址、配料表、食品生产许可证编号是否齐全;不要购买无厂名、厂址、生产日期和保质期的产品，不要购买超过保质期的产品，不要购买不合格产品。此外，购买食品后应按照标签所示方式保存、按照标示使用方法加工食用。老人、孕妇、婴幼儿、免疫力低下和易过敏人群应特别关注食品标签标示中的“食品适用人群”，散装食品注意适量购买，妥善贮藏。