早期研究表明，胃癌的发生和糜烂性胃炎等与幽门螺旋杆菌阳性有直接关系。因此，在减少幽门螺旋杆菌相当于帮助你在一定程度上远离胃癌。最近，专家说益生菌对胃中的幽门螺旋杆菌有抑制作用，可以有效减少幽门螺旋杆菌。

益生菌很容易受到环境的影响而破坏，一般认为，乳杆菌比较可以在小肠中生存繁殖，而比菲德氏菌比较能在大肠中生存繁殖，但前提是都必须先通过胃酸的考验。但最近的医学研究发现，胃中仍有少量的益生菌存活，表示部分益生菌仍可通过胃酸的考验，进入大肠或小肠中继续生存繁殖，因此医学上认为，益生菌的功能主要在肠道，而在胃中则也扮演了少量的角色。

胃幽门螺旋杆菌容易破坏胃黏膜表层，造成胃发炎等疾病，因此，益生菌对胃幽门螺旋杆菌的影响，也受到关注，有体外试验等研究发现，某些益生菌可在培养皿中抑制胃幽门螺旋杆菌的生长。

后来也有人体试验发现，雷特氏B菌、乳杆菌等益生菌，有抑制胃幽门螺旋杆菌的作用。其可能的机制是，益生菌在肠道中释放免疫调控物质，经血液到胃部，而抑制了胃幽门螺旋杆菌的生长；另外有研究认为仍有少量的益生菌在胃中存活，或许也扮演了一些辅助抑制胃幽门螺旋杆菌生长的角色。